导读 Image J详细资料大全 Image J是一个基于java的公共的图像处理软体,它是由National Institutes of Health开发的。可运行于Micr

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Image J是一个基于java的公共的图像处理软体,它是由National Institutes of Health开发的。可运行于Microsoft Windows,Mac OS,Mac OS X,Linux,和Sharp Zaurus PDA等多种平台。其基于java的特点, 使得它编写的程式能以applet等方式分发。

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Image J能够显示,编辑,分析,处理,保存,列印8位,16位,32位的图片, 支持TIFF, PNG, GIF, JPEG, BMP, DICOM, FITS等多种格式。Image J支持图像栈(stack)功能,即在一个视窗里以多执行绪的形式层叠多个图像, 并行处理。只要记忆体允许,Image J能打开任意多的图像进行处理。除了基本的图像操作, 比如缩放,旋转, 扭曲, 平滑处理外,Image J还能进行图片的区域和像素统计, 间距,角度计算, 能创建柱状图和剖面图,进行傅立叶变换。

基本介绍 软体名称 : Image J 开发商 :National Institutes of Health 软体平台 : Windows,Mac OS,Mac OS X,Linux 软体版本 :1.48 更新时间 :2014.12.17 软体语言 :java 软体大小 :4.7 软体授权 :免费/开源 定义,功能,外挂程式,其他教程丛书, 定义 1、百度文库介绍: ImageJ是一个基于java的公共的图像处理软体,它是由NationalInstitutesofHealth开发的。可运行于MicrosoftWindows,MacOS,MacOSX,Linux,和SharpZaurusPDA等多种平台。其基于java的特点,使得它编写的程式能以applet等方式分发。ImageJ能够显示,编辑,分析,处理,保存,列印8位,16位,32位的图片,支持TIFF,PNG,GIF,JPEG,BMP,DICOM,FITS等多种格式。ImageJ支持图像栈(stack)功能,即在一个视窗里以多执行绪的形式层叠多个图像,并行处理。只要记忆体允许,ImageJ能打开任意多的图像进行处理。除了基本的图像操作,比如缩放,旋转,扭曲,平滑处理外,ImageJ还能进行图片的区域和像素统计,间距,角度计算,能创建柱状图和剖面图,进行傅立叶变换。 2、科技论文介绍: ImageJ图像分析软体是美国国家心理健康研究所(NationalInstituteofMentalHealth)开发的免费科学图像分析工具,现广泛套用于生物学研究领域。ImageJ软体可计算选定区域内分析对象的一系列几何特征。分析指标包括:长度、角度、周长、面积、长轴、短轴、圆度、最佳椭圆拟合、最小外接矩形拟合以及质心坐标等。此外,ImageJ软体还支持外挂程式技术,用户可根据自身需求用java语言编写各种几何特征分析程式。 3、维基百科介绍: 是一个基于java的公共的图像处理软体,它是由National Institutes of Health开发的。可运行于Microsoft Windows,Mac OS,Mac OS X,Linux,和Sharp Zaurus PDA等多种平台。其基于java的特点, 使得它编写的程式能以applet等方式分发。 ImageJ能够显示,编辑,分析,处理,保存,列印8位,16位,32位的图片, 支持TIFF, PNG, GIF, JPEG, BMP, DICOM, FITS等多种格式。ImageJ支持图像栈功能,即在一个视窗里以多执行绪的形式层叠多个图像, 并行处理。只要记忆体允许,ImageJ能打开任意多的图像进行处理。除了基本的图像操作, 比如缩放,旋转, 扭曲, 平滑处理外,ImageJ还能进行图片的区域和像素统计, 间距,角度计算, 能创建柱状图和剖面图,进行傅立叶变换。 ImageJ是一个开放结构的软体, 支持用户自定义外挂程式和宏。ImageJ自带编辑器, 并且导入了java的编译器,实现了简单的IDE功能, 用户可直接基于ImageJ进行图像处理。 ImageJ的原始码提供免费下载 功能 概括一下,主要分为以下几个方面: 1、图像的区域和像素统计(大小),长度,角度。阳性点密度和数量。 2、光密度或辉度,并制备密度直方图和线性图。 3、结构分析如“土壤结构特征”,“表面几何特征”等。 3、卷积,Sholl分析,傅立叶分析 4、更多功能 外挂程式 ImageJ Plugin home ImageJ Plugin Project@ Sourceforge Bio-medical Imaging plugins The Image Stabilizer plugin:图像序列去抖动 OptiNav plugin set:Aeroacoustics, real time histograms, deconvolutions. Largeset of plugin *** y Gabriel Landini Albert Cardona's3D editing plugins。 Plugins forsurface asses *** entfrom GCSCA TrakEM2:a plugin for morphological data mining, image annotation and 3D modeling. 其他教程丛书 1、ImageJ图像处理与实践 较为系统地讲解了该软体的使用,从基础的软体安装到宏及外挂程式的编写:从档案格式到图像栈、超栈这些概念的介绍;从基本的图像处理理论到具体的图像粒子计数、三维重建实践。《ImageJ图像处理与实践》通过让读者了解什么是ImageJ开始,较为详尽地说明了软体各功能模组的使用及内部机制,并用6个可以套用于工程实际的图像处理实例展示了lmageJ软体的强大功能。本书主要适合涉及图像处理及其套用的高校教师、科研人员、研究生和本科生以及工程技术人员使用。 2、Image J官方简体中文快速 入门指南(参看百度文库) 3、科技论文(参看万方数据、中国知网等文献,备注:搜寻 lmage J )

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这在ImageJ里是比较常用的操作,既然两天了也没有人回答,我就唠叨一下吧。

基本上,没有特别要求,怎么照都行,可以叠加。

广义上,共聚焦图像的叠加,通常有不同两种情况:

1,multichannel,双重或多重荧光标记,不同通道不同颜色荧光,这种叠加可称为merge;

2,stack,多层光切片的叠加,一般是Z轴方向,可以有多种算法,这种叠加可称为project。

当然,这两种情况也可以共同出现(为简单见我这里只说单纯情况),一般这两种情况的处理方法不同。

我感觉你是第一种情况。我就按这个说吧:

可以根据你所使用的共聚焦提供的软件设置每个通道为不同的颜色。其实,本质上来说都是伪彩(pseudocolor),就算你用同一种颜色,之后在ImageJ里也可以随意改变成你期望的两种颜色。

我通常用leica的机器,你可能能用别牌子的机器,这都没有关系。一般机器输出的图片都可以从中分离或者在confocal自带的软件里导出成.tiff格式,这个格式大多软件都认,也包括ImageJ。

现在我默认你已经有了两个来自于同一个样品的不同荧光通道的tiff图片,现在你在imageJ里面依次将它们打开,现在到ImageJ主界面菜单栏——》Image——》color——》mergechannels选中,会跳出colormerge对话框,有几个选项我不多讲了,按着软件的默认OK就行了。试试吧

另外,如果你是Zeiss的confocal输出的文件,ImageJ(V1.45)有现成的plugin,操作会更方便一点。

还有问题的话不妨先看看help。

很简单,ImageJ是免费的软件,支持Windows、linux和Os系统,可以直接在他们的官网上下载,选择中国的节点,然后安装,其他参考

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DCM格式文件用MedImaView、、Millensys DICOM MiniViewer、DICOM Viewer等软件打开。

DCM文件是遵循DICOM (DICOM:Digital Imaging and Communications in Medicine,医疗数位影像传输协定)标准的一种文件,而DICOM标准支持的设备包括心电图、核磁共振成像 、血管镜 、超声心动图等多种医疗设备,因而DCM文件被广泛应用于医疗行业。

专业的软件是ImageJ,可以浏览和相应的处理一张或者多张DCM医学图像

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DCM文件是遵循DICOM (DICOM:Digital Imaging and Communications in

Medicine,医疗数位影像传输协定)标准的一种文件,而DICOM标准支持的设备包括心电图、核磁共振成像 、血管镜 、超声心动图等多种医疗设备,因而DCM文件被广泛应用于医疗行业。可以用MedImaView、Millensys DICOM MiniViewer、DICOM Viewer等软件打开。

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